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1Misery makes for strange bedfellows: hostile Earth pushes early Triassic mammal and amphibian to share den
http://www.esrf.eu/news/general/Triassicbedfellows
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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3d
biology
imaging
visualization
x-rays
segmentation
3dbiologyimagingvisualizationx-rayssegmentation
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1Max Planck Institute of Molecular Cell Biology and Genetics: research groups
http://www.mpi-cbg.de/research/research-groups.html
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
imaging
development
image_processing
groups
biologyimagingdevelopmentimage_processinggroups
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1Main Page - TLMtracker
http://www.tlmtracker.tu-bs.de/index.php/Main_Page
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
visualization
software
segmentation
motion_analysis
tracking
biologyvisualizationsoftwaresegmentationmotion_analysistracking
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1Live-Cell Imaging: Leica Science Lab
http://www.leica-microsystems.com/science-lab/topics/live-cell-imaging/
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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biology
cells
web
imaging
medical
to_READ
microscopy
biologycellswebimagingmedicalto_READmicroscopy
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1Labs | Janelia Farm Research Campus
http://www.janelia.org/janelia-research/labs
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
web
development
groups
biologywebdevelopmentgroups
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1Kamen's Visual Inspirations
http://kamend.tumblr.com/post/51991748059/molecularlifesciences-jtotheizzoe?utm_campaign=SharedPost&utm_medium=Email&utm_source=TumblriOS
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
cells
art
development
visualization
creative
biologycellsartdevelopmentvisualizationcreative
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1Junior-Prof. Dr. Olaf Ronneberger
http://lmb.informatik.uni-freiburg.de/people/ronneber/index.en.html
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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biology
image_processing
data_analysis
ComputerVision
groups
biologyimage_processingdata_analysisComputerVisiongroups
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1Insight Journal (ISSN 2327-770X) - Home
http://www.insight-journal.org/
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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biology
journal
imaging
medical
to_READ
image_processing
data_analysis
biologyjournalimagingmedicalto_READimage_processingdata_analysis
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1Inside Insides
http://insideinsides.blogspot.de/
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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3d
biology
imaging
medical
3dbiologyimagingmedical
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1Human Immunodeficiency Virus model
http://www.visualscience.ru/en/projects/hiv/illustrations/
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
art
visualization
tomography
biologyartvisualizationtomography
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1Human Developmental Biology Resource (HDBR) » Useful Links
http://www.hdbr.org/links/
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
web
imaging
development
atlas
human
biologywebimagingdevelopmentatlashuman
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1Human Brain Project
http://www.humanbrainproject.eu/index.html
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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imaging
development
to_READ
human
brain
biologywebimagingdevelopmentto_READhumanbrain
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1Grand Challenges in Biomedical Image Analysis
http://grand-challenge.org/All_Challenges/
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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biology
imaging
database
medical
to_READ
evaluation
data_analysis
benchmark
biologyimagingdatabasemedicalto_READevaluationdata_analysisbenchmark
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1Gastrulation
http://worms.zoology.wisc.edu/frogs/index.html
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
development
xenopus
gastrulation
biologydevelopmentxenopusgastrulation
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1FluoRender
http://www.sci.utah.edu/cibc-software/fluorender.html
vor 8 Jahren von @alex_ruff
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3d
biology
visualization
software
3dbiologyvisualizationsoftware
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1Flickr: Fernan Federici's Photostream
http://www.flickr.com/photos/anhedonias/
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
cells
art
visualization
scientific
creative
biologycellsartvisualizationscientificcreative
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2ePMV – the embedded Python Molecular Viewer
http://epmv.scripps.edu/
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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modeling
visualization
software
Python
biologymodelingvisualizationsoftwarePython
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1Embryo Imaging
http://embryoimaging.org/home
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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mouse
biology
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imaging
development
morphology
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mousebiologywebimagingdevelopmentmorphologyatlas
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1eAtlas Links
http://www.emouseatlas.org/emap/eatlas_links/eatlas_links.html
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
web
imaging
development
atlas
biologywebimagingdevelopmentatlas
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1Digital Morphology at the University of Texas
http://www.digimorph.org/index.phtml
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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tomography
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1Highly deformable bones: Unusual deformation mechanisms of seahorse armor
M. Porter, E. Novitskaya, A. Castro-Ceseña, M. Meyers, und J. McKittrick. Acta Biomaterialia, (2013)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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3d
biology
materials
imaging
morphology
tomography
segmentation
3dbiologymaterialsimagingmorphologytomographysegmentation
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1High-Speed X-ray Imaging on the Fly
D. Schwyn, R. Mokso, S. Walker, M. Doube, M. Wicklein, G. Taylor, M. Stampanoni, und H. Krapp. Synchrotron Radiation News, 26 (2): 4-10 (2013)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
in-vivo
tomography
x-rays
motion_analysis
insects
biologyin-vivotomographyx-raysmotion_analysisinsects
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4Fiji: an open-source platform for biological-image analysis
J. Schindelin, I. Arganda-Carreras, E. Frise, V. Kaynig, M. Longair, T. Pietzsch, S. Preibisch, C. Rueden, S. Saalfeld, B. Schmid und 6 andere Autor(en). Nat Meth, 9 (7): 676--682 (Juli 2012)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
visualization
software
data_analysis
segmentation
biologyvisualizationsoftwaredata_analysissegmentation
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1Fast, accurate reconstruction of cell lineages from large-scale fluorescence microscopy data
F. Amat, W. Lemon, D. Mossing, K. McDole, Y. Wan, K. Branson, E. Myers, und P. Keller. Nat Meth, 11 (9): 951--958 (September 2014)
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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optical_flow
biology
cells
to_READ
software
of_applications
zebrafish
segmentation
tracking
microscopy
optical_flowbiologycellsto_READsoftwareof_applicationszebrafishsegmentationtrackingmicroscopy
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2Fast and robust optical flow for time-lapse microscopy using super-voxels
F. Amat, E. Myers, und P. Keller. Bioinformatics, 29 (3): 373-380 (2013)
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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optical_flow
biology
of_applications
zebrafish
microscopy
optical_flowbiologyof_applicationszebrafishmicroscopy
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1Effects of Ionizing Radiation on Embryos of the Tardigrade Milnesium cf. <italic>tardigradum</italic> at Different Stages of Development
E. Beltrán-Pardo, K. Jönsson, A. Wojcik, S. Haghdoost, M. Harms-Ringdahl, R. Bermúdez-Cruz, und J. Bernal Villegas. PLoS ONE, 8 (9): e72098 (September 2013)
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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biology
to_READ
biologyto_READ
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1Details of Insect Wing Design and Deformation Enhance Aerodynamic Function and Flight Efficiency
J. Young, S. Walker, R. Bomphrey, G. Taylor, und A. Thomas. Science, 325 (5947): 1549-1552 (2009)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
imaging
in-vivo
motion_analysis
insects
biologyimagingin-vivomotion_analysisinsects
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1Defying death after DNA damage
T. Rich, R. Allen, und A. Wyllie. Nature, 407 (6805): 777-783 (Oktober 2000)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
medical
biologymedical
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2Chaste: An Open Source C++ Library for Computational Physiology and Biology
G. Mirams, C. Arthurs, M. Bernabeu, R. Bordas, J. Cooper, A. Corrias, Y. Davit, S. Dunn, A. Fletcher, D. Harvey und 7 andere Autor(en). PLoS Comput Biol, 9 (3): e1002970 (März 2013)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
software
algorithms
simulation
computation
biologysoftwarealgorithmssimulationcomputation
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3Chapter 17: Bioimage Informatics for Systems Pharmacology
F. Li, Z. Yin, G. Jin, H. Zhao, und S. Wong. PLoS Comput Biol, 9 (4): e1003043 (April 2013)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
to_READ
software
algorithms
data_analysis
segmentation
survey
motion_analysis
biologyto_READsoftwarealgorithmsdata_analysissegmentationsurveymotion_analysis
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1Cellular and Subcellular Structure of Neoproterozoic Animal Embryos
J. Hagadorn, S. Xiao, P. Donoghue, S. Bengtson, N. Gostling, M. Pawlowska, E. Raff, R. Raff, F. Turner, Y. Chongyu und 5 andere Autor(en). Science, 314 (5797): 291-294 (2006)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
development
tomography
x-rays
biologydevelopmenttomographyx-rays
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1Cell tracking in fluorescence images of embryogenesis processes with morphological reconstruction by 4D-tubular structuring elements
D. Pastor, M. Luengo-Oroz, B. Lombardot, I. Gonzalvez, L. Duloquin, T. Savy, P. Bourgine, N. Peyrieras, und A. Santos. Engineering in Medicine and Biology Society, 2009. EMBC 2009. Annual International Conference of the IEEE, Seite 970-973. (2009)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
cells
development
morphology
embryos
tracking
biologycellsdevelopmentmorphologyembryostracking
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1Cadherin-11 regulates protrusive activity in Xenopus cranial neural crest cells upstream of Trio and the small GTPases
J. Kashef, A. Köhler, S. Kuriyama, D. Alfandari, R. Mayor, und D. Wedlich. Genes Dev, 23 (12): 1393-1398 (Juni 2009)
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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biology
development
xenopus
biologydevelopmentxenopus
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1BrainAligner: 3D registration atlases of Drosophila brains
H. Peng, P. Chung, F. Long, L. Qu, A. Jenett, A. Seeds, E. Myers, und J. Simpson. Nat Methods, 8 (6): 493-500 (Juni 2011)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
medical
visualization
software
scientific
segmentation
registration
biologymedicalvisualizationsoftwarescientificsegmentationregistration
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1Brain-wide 3D imaging of neuronal activity in Caenorhabditis elegans with sculpted light
T. Schrodel, R. Prevedel, K. Aumayr, M. Zimmer, und A. Vaziri. Nat Meth, (September 2013)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
imaging
embryos
microscopy
brain
3dbiologyimagingembryosmicroscopybrain
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1Biological imaging software tools
K. Eliceiri, M. Berthold, I. Goldberg, L. Ibanez, B. Manjunath, M. Martone, R. Murphy, H. Peng, A. Plant, B. Roysam und 4 andere Autor(en). Nat Meth, 9 (7): 697--710 (Juli 2012)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
imaging
to_READ
software
data_analysis
biologyimagingto_READsoftwaredata_analysis
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1Automated Processing of Zebrafish Imaging Data: A Survey
R. Mikut, T. Dickmeis, W. Driever, P. Geurts, F. Hamprecht, B. Kausler, M. Ledesma-Carbayo, R. MarÃ©e, K. Mikula, P. Pantazis und 5 andere Autor(en). Zebrafish, 10 (3): 401-421 (2013)PMID: 23758125.
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imaging
embryos
to_READ
data_analysis
zebrafish
survey
biologyimagingembryosto_READdata_analysiszebrafishsurvey
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1Advances in biological structure, function, and physiology using synchrotron X-ray imaging*
M. Westneat, J. Socha, und W. Lee. Annu Rev Physiol, (2008)
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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imaging
morphology
tomography
insects
applications
biologyimagingmorphologytomographyinsectsapplications
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1A virtual world of paleontology
J. Cunningham, I. Rahman, S. Lautenschlager, E. Rayfield, und P. Donoghue. Trends in Ecology & Evolution, 29 (6): 347 - 357 (2014)
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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software
tomography
survey
graphics
applications
3Dbiologysoftwaretomographysurveygraphicsapplications
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1A Discrete Chain Graph Model for 3d+t Cell Tracking with High Misdetection Robustness
B. Kausler, M. Schiegg, B. Andres, M. Lindner, U. Koethe, H. Leitte, J. Wittbrodt, L. Hufnagel, und F. Hamprecht. Computer Vision – ECCV 2012, Volume 7574 von Lecture Notes in Computer Science, Springer Berlin Heidelberg, (2012)
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motion_analysis
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