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1Insight Journal (ISSN 2327-770X) - Home
http://www.insight-journal.org/
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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1CodaLab - Home
https://www.codalab.org/
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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data_analysis
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data_analysisprogrammingsoftware
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1Grand Challenges in Biomedical Image Analysis
http://grand-challenge.org/All_Challenges/
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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imaging
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benchmarkbiologydata_analysisdatabaseevaluationimagingmedicalto_READ
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1Fast Fourier Transform and Its Applications: E. Brigham: 9780133075052: Amazon.com: Books
http://www.amazon.com/Fast-Fourier-Transform-Its-Applications/dp/0133075052
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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data_analysis
filtering
image_processing
bookdata_analysisfilteringimage_processing
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1Lecture
http://www-ekp.physik.uni-karlsruhe.de/~giffels/PythonForDataAnalysis.html
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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Python
data_analysis
programming
tutorial
Pythondata_analysisprogrammingtutorial
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1Computer Vision Group, Freiburg
http://lmb.informatik.uni-freiburg.de/research/funded_projects/bioss_4d_analyser/
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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biology
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groups
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software
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biologydata_analysisgroupssegmentationsoftwarevisualization
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2Heidelberg Collaboratory for Image Processing
http://hci.iwr.uni-heidelberg.de/
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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ComputerVision
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image_processing
imaging
ComputerVisiondata_analysisgroupsimage_processingimaging
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1Junior-Prof. Dr. Olaf Ronneberger
http://lmb.informatik.uni-freiburg.de/people/ronneber/index.en.html
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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ComputerVision
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data_analysis
groups
image_processing
ComputerVisionbiologydata_analysisgroupsimage_processing
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1Neural Networks for Pattern Recognition Advanced Texts in Econometrics: Amazon.co.uk: C.M. Bishop: Books
http://www.amazon.co.uk/Neural-Networks-Pattern-Recognition-Bishop/dp/0198538642
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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book
data_analysis
learning
object_recognition
statistics
bookdata_analysislearningobject_recognitionstatistics
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13MathJax
http://www.mathjax.org/
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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graphics
math
software
visualization
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data_analysisgraphicsmathsoftwarevisualizationweb
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2Flot: Attractive JavaScript plotting for jQuery
http://www.flotcharts.org/
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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graphics
math
software
visualization
web
data_analysisgraphicsmathsoftwarevisualizationweb
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4Mike Bostock
http://bost.ocks.org/mike/
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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creative
data_analysis
visualization
web
algorithmscreativedata_analysisvisualizationweb
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1The Connectome Mapping Toolkit — CMTK
http://www.cmtk.org/
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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3d
Python
anatomy
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medical
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3dPythonanatomydata_analysismedicalsoftwarevisualization
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1SciPy Tutorial — SciPy v0.13.0 Reference Guide
http://docs.scipy.org/doc/scipy/reference/tutorial/index.html
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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Python
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programming
scientific
tutorial
Pythondata_analysisprogrammingscientifictutorial
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1bioss - Centre for Biological Signalling Studies
http://www.bioss.uni-freiburg.de/cms/index.php
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biologydata_analysisgroupsvisualization
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1MIPAV: Medical Image Processing, Analysis and Visualization
http://mipav.cit.nih.gov/
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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3d
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filtering
medical
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visualization
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1MOSAIC group: MOdels, Simulations, and Algorithms for Interdisciplinary Computing
http://mosaic.mpi-cbg.de/?q=welcome
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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groups
image_processing
imaging
microscopy
software
biologydata_analysisgroupsimage_processingimagingmicroscopysoftware
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1DREAM.3D: Digital Representation Environment for Analyzing Microstructure in 3D
http://dream3d.bluequartz.net/project/about/index.html
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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3d
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modeling
morphology
simulation
software
statistics
3ddata_analysismodelingmorphologysimulationsoftwarestatistics
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1Microstructure Analysis - Fraunhofer-Institut für Techno- und Wirtschaftsmathematik ITWM
http://www.itwm.fraunhofer.de/en/departments/image-processing/microstructure-analysis.html
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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groups
image_processing
morphology
segmentation
data_analysisgroupsimage_processingmorphologysegmentation
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1Media Cybernetics - Image Analysis Software | Image Processing Software | Image Deconvolution
http://www.mediacy.com/index.aspx?page=Home
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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software
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1Measuring the accuracy of diagnostic systems
J. Swets. Science, 240 (4857): 1285-1293 (Juni 1988)
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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algorithms
data_analysis
statistics
algorithmsdata_analysisstatistics
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3NIH Image to ImageJ: 25 years of image analysis
C. Schneider, W. Rasband, und K. Eliceiri. Nat Meth, 9 (7): 671--675 (Juli 2012)
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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biology
data_analysis
segmentation
software
visualization
biologydata_analysissegmentationsoftwarevisualization
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1Industrial image processing : visual quality control in manufacturing
C. Demant, C. Garnica, und B. Streicher-Abel. (2013)
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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book
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image_processing
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bookdata_analysisimage_processingobject_recognition
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2Robust single-particle tracking in live-cell time-lapse sequences
K. Jaqaman, D. Loerke, M. Mettlen, H. Kuwata, S. Grinstein, S. Schmid, und G. Danuser. Nat Meth, 5 (8): 695--702 (August 2008)
vor 10 Jahren von @alex_ruff
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biology
cells
data_analysis
in-vivo
medical
motion_analysis
software
tracking
biologycellsdata_analysisin-vivomedicalmotion_analysissoftwaretracking
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3Segmentation and tracking of migrating cells in videomicroscopy with parametric active contours: a tool for cell-based drug testing
C. Zimmer, E. Labruyere, V. Meas-Yedid, N. Guillen, und J. Olivo-Marin. Medical Imaging, IEEE Transactions on, 21 (10): 1212-1221 (2002)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
cells
data_analysis
development
microscopy
segmentation
tracking
biologycellsdata_analysisdevelopmentmicroscopysegmentationtracking
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1Image analysis for understanding embryo development: a bridge from microscopy to biological insights
M. Luengo-Oroz, M. Ledesma-Carbayo, N. Peyriéras, und A. Santos. Current Opinion in Genetics & Development, 21 (5): 630 - 637 (2011)Developmental mechanisms, patterning and evolution.
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
cells
data_analysis
development
microscopy
segmentation
tracking
biologycellsdata_analysisdevelopmentmicroscopysegmentationtracking
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1Rotation-Invariant HOG Descriptors Using Fourier Analysis in Polar and Spherical Coordinates
K. Liu, H. Skibbe, T. Schmidt, T. Blein, K. Palme, T. Brox, und O. Ronneberger. International Journal of Computer Vision, (2013)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
data_analysis
object_recognition
segmentation
biologydata_analysisobject_recognitionsegmentation
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1Automated Processing of Zebrafish Imaging Data: A Survey
R. Mikut, T. Dickmeis, W. Driever, P. Geurts, F. Hamprecht, B. Kausler, M. Ledesma-Carbayo, R. MarÃ©e, K. Mikula, P. Pantazis und 5 andere Autor(en). Zebrafish, 10 (3): 401-421 (2013)PMID: 23758125.
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
data_analysis
embryos
imaging
survey
to_READ
zebrafish
biologydata_analysisembryosimagingsurveyto_READzebrafish
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1Software tools, data structures, and interfaces for microscope imaging
N. Stuurman, und J. Swedlow. Cold Spring Harb Protoc, 2012 (1): 50-61 (Januar 2012)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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data_analysis
image_processing
imaging
microscopy
software
survey
data_analysisimage_processingimagingmicroscopysoftwaresurvey
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2Visualization of image data from cells to organisms
T. Walter, D. Shattuck, R. Baldock, M. Bastin, A. Carpenter, S. Duce, J. Ellenberg, A. Fraser, N. Hamilton, S. Pieper und 4 andere Autor(en). Nat Methods, 7 (3 Suppl): 26-41 (März 2010)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
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image_processing
microscopy
software
survey
to_READ
visualization
biologydata_analysisimage_processingmicroscopysoftwaresurveyto_READvisualization
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1Bayesian image analysis with on-line confidence estimates and its application to microtubule tracking
J. Cardinale, A. Rauch, Y. Barral, G. Szekely, und I. Sbalzarini. Biomedical Imaging: From Nano to Macro, 2009. ISBI '09. IEEE International Symposium on, Seite 1091-1094. (2009)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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data_analysis
image_processing
statistics
to_READ
data_analysisimage_processingstatisticsto_READ
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1Quantitative motion analysis and visualization of cellular structures
D. Gerlich, J. Mattes, und R. Eils. Methods, 29 (1): 3 - 13 (2003)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
data_analysis
motion_analysis
to_READ
visualization
biologydata_analysismotion_analysisto_READvisualization
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3Data analysis with open source tools
P. Janert. O'Reilly, Sebastopol, CA, (2011)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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book
data_analysis
programming
bookdata_analysisprogramming
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2Python for data analysis : agile tools for real-world data
W. McKinney. O'Reilly, Sebastopol, CA, (2013)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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Python
book
data_analysis
programming
Pythonbookdata_analysisprogramming
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3X-ray phase-contrast in vivo microtomography probes new aspects of Xenopus gastrulation
J. Moosmann, A. Ershov, V. Altapova, T. Baumbach, M. Prasad, C. LaBonne, X. Xiao, J. Kashef, und R. Hofmann. Nature, 497 (7449): 374--377 (Mai 2013)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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data_analysis
gastrulation
myPUB
optical_flow
tomography
x-rays
xenopus
data_analysisgastrulationmyPUBoptical_flowtomographyx-raysxenopus
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1Biological imaging software tools
K. Eliceiri, M. Berthold, I. Goldberg, L. Ibanez, B. Manjunath, M. Martone, R. Murphy, H. Peng, A. Plant, B. Roysam und 4 andere Autor(en). Nat Meth, 9 (7): 697--710 (Juli 2012)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
data_analysis
imaging
software
to_READ
biologydata_analysisimagingsoftwareto_READ
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3Chapter 17: Bioimage Informatics for Systems Pharmacology
F. Li, Z. Yin, G. Jin, H. Zhao, und S. Wong. PLoS Comput Biol, 9 (4): e1003043 (April 2013)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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algorithms
biology
data_analysis
motion_analysis
segmentation
software
survey
to_READ
algorithmsbiologydata_analysismotion_analysissegmentationsoftwaresurveyto_READ
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4Fiji: an open-source platform for biological-image analysis
J. Schindelin, I. Arganda-Carreras, E. Frise, V. Kaynig, M. Longair, T. Pietzsch, S. Preibisch, C. Rueden, S. Saalfeld, B. Schmid und 6 andere Autor(en). Nat Meth, 9 (7): 676--682 (Juli 2012)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
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software
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biologydata_analysissegmentationsoftwarevisualization
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1Spatial information dynamics during early zebrafish development
J. Hoh, W. Heinz, und J. Werbin. Developmental Biology, 377 (1): 126 - 137 (2013)
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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biology
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zebrafish
biologydata_analysisdevelopmentstatisticsto_READzebrafish
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1X-ray imaging and analysis techniques for quantifying pore-scale structure and processes in subsurface porous medium systems
D. Wildenschild, und A. Sheppard. Advances in Water Resources, 51 (0): 217 - 246 (2013)35th Year Anniversary Issue.
vor 11 Jahren von @alex_ruff
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3d
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segmentation
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tomography
x-rays
3ddata_analysisfoamsimagingsegmentationto_READtomographyx-rays
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