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1When is correlation transitive? | What's new
https://terrytao.wordpress.com/2014/06/05/when-is-correlation-transitive/
vor 2 Jahren von @becker
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correlation
transitivity
transitive
corals
fastcor
correlationtransitivitytransitivecoralsfastcor
(0)
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- Community-Eintrag
- Versionsverlauf dieses Eintrags
1inference - How to infer correlations from correlations - Cross Validated
https://stats.stackexchange.com/questions/122888/how-to-infer-correlations-from-correlations
vor 2 Jahren von @becker
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correlation
bounds
interval
transitivity
transitive
cor
fastcor
corals
correlationboundsintervaltransitivitytransitivecorfastcorcorals
(0)
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- Community-Eintrag
- Versionsverlauf dieses Eintrags
1scwatts/fastspar: Rapid and scalable correlation estimation for compositional data
https://github.com/scwatts/fastspar
vor 2 Jahren von @becker
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correlation
network
project:fastcor
algorithm
c
sparse
correlationnetworkproject:fastcoralgorithmcsparse
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- Community-Eintrag
- Versionsverlauf dieses Eintrags
1shafferm/SCNIC: Sparse Cooccurence Network Investigation for Compositional data
https://github.com/shafferm/SCNIC
vor 2 Jahren von @becker
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project:fastcor
compositional
data
correlation
positive
co-occurrence
coocurrence
network
analysis
project:fastcorcompositionaldatacorrelationpositiveco-occurrencecoocurrencenetworkanalysis
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- Community-Eintrag
- Versionsverlauf dieses Eintrags
1PyOD: a Unified Python Library for Anomaly Detection | by Alexandra Amidon | May, 2021 | Towards Data Science
https://towardsdatascience.com/pyod-a-unified-python-library-for-anomaly-detection-3608ec1fe321
vor 3 Jahren von @becker
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cordis
correlation
detection
disruption
outlier
cordiscorrelationdetectiondisruptionoutlier
(0)
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- Community-Eintrag
- Versionsverlauf dieses Eintrags
1Differential co-expression-based detection of conditional relationships in transcriptional data: comparative analysis and application to breast cancer | SpringerLink
https://link.springer.com/article/10.1186/s13059-019-1851-8
vor 3 Jahren von @becker
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differential
coexpression
correlation
dgca
review
survey
gene
paper:fastcor
differentialcoexpressioncorrelationdgcareviewsurveygenepaper:fastcor
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- Community-Eintrag
- Versionsverlauf dieses Eintrags
1ryananeff/DGCA: DGCA 2.0: Highly Parallel and Memory-efficient Differential Correlation analysis
https://github.com/ryananeff/DGCA
vor 3 Jahren von @becker
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dgca
parallel
fast
differential
gene
analysis
correlation
paper:fastcor
dgcaparallelfastdifferentialgeneanalysiscorrelationpaper:fastcor
(0)
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- Community-Eintrag
- Versionsverlauf dieses Eintrags
1Large scale correlation mining: fundamental performance limits
http://web.eecs.umich.edu/~hero/Preprints/hero_duke_SAHD15.pdf
vor 3 Jahren von @becker
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correlation
mining
estimation
statistical
test
paper:fastcor
correlationminingestimationstatisticaltestpaper:fastcor
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1Bootstrapping Correlations
https://www.uvm.edu/~statdhtx/StatPages/Randomization%20Tests/BootstCorr/bootstrapping_correlations.html
vor 3 Jahren von @becker
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bootstrap
correlation
references
papers
bootstrapping
overview
example
bootstrapcorrelationreferencespapersbootstrappingoverviewexample
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2Three correlations and a samosa – Picture this maths
https://picturethismaths.wordpress.com/2020/10/31/three-correlations-and-a-samosa/
vor 3 Jahren von @becker
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correlation
samosa
transitivity
pearson
correlationsamosatransitivitypearson
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- Versionsverlauf dieses Eintrags
1ikizhvatov/efficient-columnwise-correlation: Efficient ways to compute Pearson's correlation between columns of two matrices in various scientific computing languages
https://github.com/ikizhvatov/efficient-columnwise-correlation
vor 4 Jahren von @becker
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correlation
cor
python
julia
r
comparison
efficient
fast
implementation
benchmark
correlationcorpythonjuliarcomparisonefficientfastimplementationbenchmark
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- Community-Eintrag
- Versionsverlauf dieses Eintrags
2Latent graph neural networks: Manifold learning 2.0? | by Michael Bronstein | Sep, 2020 | Towards Data Science
https://towardsdatascience.com/manifold-learning-2-99a25eeb677d
vor 4 Jahren von @becker
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cell
cnn
convolutional
correlation
disruption
dynamic
functional
graph
interaction
network
neural
nn
pointnet
single
cellcnnconvolutionalcorrelationdisruptiondynamicfunctionalgraphinteractionnetworkneuralnnpointnetsingle
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1DGCA: A comprehensive R package for Differential Gene Correlation Analysis - PubMed
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27846853/
vor 4 Jahren von @becker
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differential
gene
expression
correlation
disruption
cordis
differentialgeneexpressioncorrelationdisruptioncordis
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1Lewandowski-Kurowicka-Joe (LKJ) distribution — Probability Distribution Explorer documentation
http://bois.caltech.edu/distribution_explorer/multivariate_continuous/lkj.html
vor 4 Jahren von @becker
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correlation
disruption
cordis
distribution
probability
matrix
covariance
multvariate
project
correlationdisruptioncordisdistributionprobabilitymatrixcovariancemultvariateproject
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1Distance correlation - Wikipedia
https://en.wikipedia.org/wiki/Distance_correlation
vor 5 Jahren von @becker
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classifier
correlation
distance
nalab
classifiercorrelationdistancenalab
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1How to use Pearson correlation correctly with time series - Cross Validated
https://stats.stackexchange.com/questions/133155/how-to-use-pearson-correlation-correctly-with-time-series
vor 5 Jahren von @becker
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spurious
correlation
pearson
time
series
timeseries
spuriouscorrelationpearsontimeseriestimeseries
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- Versionsverlauf dieses Eintrags
1A parallel and sparse approach to calculating correlations between columns of a Pandas DataFrame
https://gist.github.com/mgbckr/12d2f039173d3dffce20f0db3bac9159
vor 5 Jahren von @becker
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correlation
correlations
pearson
parallel
joblib
sparse
scipy
pandas
numpy
dataframe
df
fast
correlationcorrelationspearsonparalleljoblibsparsescipypandasnumpydataframedffast
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1The perils of leave-one-out crossvalidation for individual difference analyses
http://www.russpoldrack.org/2012/
vor 5 Jahren von @becker
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cross
validation
leave
one
out
loo
negative
correlation
linear
regression
elastic
net
en
crossvalidationleaveoneoutloonegativecorrelationlinearregressionelasticneten
(0)
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- Versionsverlauf dieses Eintrags
1Response to “Perils of LOO crossvalidation”
http://not2hastie.tumblr.com/
vor 5 Jahren von @becker
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cross
validation
leave
one
out
loo
negative
correlation
linear
regression
elastic
net
en
crossvalidationleaveoneoutloonegativecorrelationlinearregressionelasticneten
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1CloudyDay - @HackMIT
http://cond.in/hackmit/
vor 10 Jahren von @becker
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correlation
graph
plot
sentiment
twitter
weather
correlationgraphplotsentimenttwitterweather
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6The max-min hill-climbing Bayesian network structure learning algorithm
I. Tsamardinos, L. Brown, und C. Aliferis. Machine learning, 65 (1): 31--78 (2006)
vor 2 Jahren von @becker
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paper:fastcor
partial
correlation
causation
bayesian
bayes
network
citedby:scholar:count:1912
citedby:scholar:timestamp:2022-9-23
paper:fastcorpartialcorrelationcausationbayesianbayesnetworkcitedby:scholar:count:1912citedby:scholar:timestamp:2022-9-23
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1Corruption of the Pearson correlation coefficient by measurement error and its estimation, bias, and correction under different error models
E. Saccenti, M. Hendriks, und A. Smilde. Scientific reports, 10 (1): 1--19 (2020)
vor 2 Jahren von @becker
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paper:fastcor
correlation
error
data
bias
estimation
correction
citedby:scholar:count:53
citedby:scholar:timestamp:2022-9-23
paper:fastcorcorrelationerrordatabiasestimationcorrectioncitedby:scholar:count:53citedby:scholar:timestamp:2022-9-23
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1DiffCorr: an R package to analyze and visualize differential correlations in biological networks
A. Fukushima. Gene, 518 (1): 209--214 (2013)
vor 2 Jahren von @becker
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paper:fastcor
differential
correlation
analysis
citedby:scholar:count:142
citedby:scholar:timestamp:2022-9-18
paper:fastcordifferentialcorrelationanalysiscitedby:scholar:count:142citedby:scholar:timestamp:2022-9-18
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2The discordant method: a novel approach for differential correlation
C. Siska, R. Bowler, und K. Kechris. Bioinformatics, 32 (5): 690--696 (2016)
vor 2 Jahren von @becker
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paper:fastcor
differential
correlation
analysis
citedby:scholar:count:28
citedby:scholar:timestamp:2022-9-18
paper:fastcordifferentialcorrelationanalysiscitedby:scholar:count:28citedby:scholar:timestamp:2022-9-18
(0)
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2DCARS: differential correlation across ranked samples
S. Ghazanfar, D. Strbenac, J. Ormerod, J. Yang, und E. Patrick. Bioinformatics, 35 (5): 823--829 (2019)
vor 2 Jahren von @becker
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paper:fastcor
differential
correlation
analysis
citedby:scholar:count:5
citedby:scholar:timestamp:2022-9-18
paper:fastcordifferentialcorrelationanalysiscitedby:scholar:count:5citedby:scholar:timestamp:2022-9-18
(0)
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2Comparison of the predicted and observed secondary structure of T4 phage lysozyme
B. Matthews. Biochimica et Biophysica Acta (BBA)-Protein Structure, 405 (2): 442--451 (1975)
vor 2 Jahren von @becker
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paper:fastcor
phi
coefficient
correlation
binary
citedby:scholar:count:4936
citedby:scholar:timestamp:2022-9-12
paper:fastcorphicoefficientcorrelationbinarycitedby:scholar:count:4936citedby:scholar:timestamp:2022-9-12
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2Reducing bias and error in the correlation coefficient due to nonnormality
A. Bishara, und J. Hittner. Educational and psychological measurement, 75 (5): 785--804 (2015)
vor 2 Jahren von @becker
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paper:fastcor
correlation
coefficient
sampling
normality
bias
error
citedby:scholar:count:172
citedby:scholar:timestamp:2022-9-10
paper:fastcorcorrelationcoefficientsamplingnormalitybiaserrorcitedby:scholar:count:172citedby:scholar:timestamp:2022-9-10
(0)
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1A tutorial on regularized partial correlation networks.
S. Epskamp, und E. Fried. Psychological methods, 23 (4): 617 (2018)
vor 2 Jahren von @becker
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paper:fastcor
partial
correlation
network
networks
citedby:scholar:count:1004
citedby:scholar:timestamp:2022-9-10
paper:fastcorpartialcorrelationnetworknetworkscitedby:scholar:count:1004citedby:scholar:timestamp:2022-9-10
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1Partial correlation coefficients
B. Brown, und S. Hendrix. Encyclopedia of statistics in behavioral science, (2005)
vor 2 Jahren von @becker
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paper:fastcor
partial
correlation
coefficient
citedby:scholar:count:23
citedby:scholar:timestamp:2022-9-10
paper:fastcorpartialcorrelationcoefficientcitedby:scholar:count:23citedby:scholar:timestamp:2022-9-10
(0)
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1Genetic and environmental perturbations lead to regulatory decoherence
A. Lea, M. Subramaniam, A. Ko, T. Lehtimäki, E. Raitoharju, M. Kähönen, I. Seppälä, N. Mononen, O. Raitakari, M. Ala-Korpela und 1 andere Autor(en). Elife, (2019)
vor 2 Jahren von @becker
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cordis
differential
correlation
network
networks
coherence
decoherence
genetic
gene
regulatory
citedby:scholar:count:28
citedby:scholar:timestamp:2022-7-28
cordisdifferentialcorrelationnetworknetworkscoherencedecoherencegeneticgeneregulatorycitedby:scholar:count:28citedby:scholar:timestamp:2022-7-28
(0)
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4A shrinkage approach to large-scale covariance matrix estimation and implications for functional genomics
J. Schäfer, und K. Strimmer. Statistical applications in genetics and molecular biology, (2005)
vor 2 Jahren von @becker
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paper:fastcor
regularization
correlation
citedby:scholar:count:1699
citedby:scholar:timestamp:2022-4-27
paper:fastcorregularizationcorrelationcitedby:scholar:count:1699citedby:scholar:timestamp:2022-4-27
(0)
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1Profiling functional disruption in biological systems
M. Becker, D. Feyaerts, I. Stelzer, E. Berson, A. Chang, C. Espinosa, D. Francesco, R. Fallahzadeh, I. Maric, S. Mataraso und 10 andere Autor(en). Under review, (2022)
vor 2 Jahren von @becker
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correlation
disruption
functional
myown
skipstats
correlationdisruptionfunctionalmyownskipstats
(0)
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2Large-scale correlation network construction for unraveling the coordination of complex biological systems
M. Becker, H. Nassar, C. Espinosa, I. Stelzer, D. Feyaerts, E. Berson, N. Bidoki, A. Chang, G. Saarunya, A. Culos und 20 andere Autor(en). Nature Computational Science, (April 2023)
vor 2 Jahren von @becker
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correlation
myown
project:2023-tracking
skipstats
correlationmyownproject:2023-trackingskipstats
(0)
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1Measuring and testing dependence by correlation of distances
G. Székely, M. Rizzo, und N. Bakirov. The annals of statistics, 35 (6): 2769--2794 (2007)
vor 2 Jahren von @becker
alle anzeigen
um1
correlation
distances
distance
citedby:scholar:count:1952
citedby:scholar:timestamp:2022-1-28
um1correlationdistancesdistancecitedby:scholar:count:1952citedby:scholar:timestamp:2022-1-28
(0)
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2CorDiffViz: an R package for visualizing multi-omics differential correlation networks
S. Yu, M. Drton, D. Promislow, und A. Shojaie. BMC bioinformatics, 22 (1): 1--12 (2021)
vor 2 Jahren von @becker
alle anzeigen
correlation
difference
differential
visualization
network
networks
fastcor
paper:fastcor
correlationdifferencedifferentialvisualizationnetworknetworksfastcorpaper:fastcor
(0)
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1Co-Operation: Fast Correlation, Covariance, and Cosine Similarity
D. Schmidt. (2021)R package version 0.6-3.
vor 3 Jahren von @becker
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baseline
comparison
correlation
paper:fastcor
baselinecomparisoncorrelationpaper:fastcor
(0)
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2Fast R Functions for Robust Correlations and Hierarchical Clustering
P. Langfelder, und S. Horvath. Journal of Statistical Software, 46 (11): 1--17 (2012)
vor 3 Jahren von @becker
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baseline
comparison
correlation
paper:fastcor
baselinecomparisoncorrelationpaper:fastcor
(0)
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1Rfast: A Collection of Efficient and Extremely Fast R Functions
M. Papadakis, M. Tsagris, M. Dimitriadis, S. Fafalios, I. Tsamardinos, M. Fasiolo, G. Borboudakis, J. Burkardt, C. Zou, K. Lakiotaki und 1 andere Autor(en). (2021)R package version 2.0.3.
vor 3 Jahren von @becker
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baseline
comparison
correlation
paper:fastcor
baselinecomparisoncorrelationpaper:fastcor
(0)
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1Forward regression in R: from the extreme slow to the extreme fast
M. Tsagris, und M. Papadakis. Journal of Data Science, 16 (4): 771--780 (2018)
vor 3 Jahren von @becker
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paper:fastcor
correlation
comparison
baseline
citedby:scholar:count:1
citedby:scholar:timestamp:2021-9-25
paper:fastcorcorrelationcomparisonbaselinecitedby:scholar:count:1citedby:scholar:timestamp:2021-9-25
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3Explainable classification of brain networks via contrast subgraphs
T. Lanciano, F. Bonchi, und A. Gionis. Proceedings of the 26th ACM SIGKDD International Conference on Knowledge Discovery & Data Mining, Seite 3308--3318. (2020)
vor 3 Jahren von @becker
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kdd
contrast
subgraphs
graphs
correlation
disruption
networks
classification
explainable
interpretable
machine
learning
citedby:scholar:count:4
citedby:scholar:timestamp:2021-8-8
kddcontrastsubgraphsgraphscorrelationdisruptionnetworksclassificationexplainableinterpretablemachinelearningcitedby:scholar:count:4citedby:scholar:timestamp:2021-8-8
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