peter.ralph > software

Lesezeichen (verstecken)16
Anzeige
alles
nur Lesezeichen
Lesezeichen pro Seite
5
10
20
50
100
sortieren nach
hinzugefügt am
Titel
RSS
BibTeX
XML

1Python GDAL/OGR Cookbook
https://pcjericks.github.io/py-gdalogr-cookbook/
vor 6 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
reference
python
software
spatial_statistics
referencepythonsoftwarespatial_statistics
KopierenLöschen
- Community-Eintrag
- Versionsverlauf dieses Eintrags
4Repast Suite
http://repast.sourceforge.net/
vor 9 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
software
agent-based_simulation
ecological_modeling
softwareagent-based_simulationecological_modeling
KopierenLöschen
- Community-Eintrag
- Versionsverlauf dieses Eintrags
1RPubs - Visual Raster Cheatsheet
http://rpubs.com/etiennebr/visualraster
vor 9 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
reference
R
software
methods
geostatistics
raster
referenceRsoftwaremethodsgeostatisticsraster
KopierenLöschen
- Community-Eintrag
- Versionsverlauf dieses Eintrags
1SDMTools
Species Distribution Modelling Tools: Tools for processing data associated with species distribution modelling exercises
vor 11 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
fractal_landscape
software
fractal_landscapesoftware
KopierenLöschen
- Community-Eintrag
- Versionsverlauf dieses Eintrags
1Spatial data in R: Using R as a GIS
https://pakillo.github.io/R-GIS-tutorial/#spatialsync
vor 9 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
GIS
reference
R
software
geostatistics
GISreferenceRsoftwaregeostatistics
KopierenLöschen
- Community-Eintrag
- Versionsverlauf dieses Eintrags
1vimdiff
http://amjith.blogspot.com/2008/08/quick-and-dirty-vimdiff-tutorial.html
vor 10 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
software
tools
softwaretools
KopierenLöschen
- Community-Eintrag
- Versionsverlauf dieses Eintrags

⟨⟨
⟨
1
2
⟩
⟩⟩

Publikationen (verstecken)58
Anzeige
alles
nur Publikationen
Publikationen pro Seite
5
10
20
50
100
sortieren nach
hinzugefügt am
Titel
Autor
Erscheinungsdatum
Eintragstyp
Hilfe für erweiterte Sortierung...
RSS
BibTeX
RDF
mehr...

2A C++ template library for efficient forward-time population genetic simulation of large populations
K. Thornton. (2014)cite arxiv:1401.3786.
vor 10 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
software
forwards_time
simulation
demographic_inference
softwareforwards_timesimulationdemographic_inference
KopierenLöschenDiese Publikation zur Ablage hinzufügen
2A C++ template library for efficient forward-time population genetic simulation of large populations
K. Thornton. Genetics, 198 (1): 157-166 (September 2014)
vor 8 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
software
forwards_time
methods
simulation
softwareforwards_timemethodssimulation
KopierenLöschenDiese Publikation zur Ablage hinzufügen
1A community-maintained standard library of population genetic models
J. Adrion, C. Cole, N. Dukler, J. Galloway, A. Gladstein, G. Gower, C. Kyriazis, A. Ragsdale, G. Tsambos, F. Baumdicker und 18 andere Autor(en). bioRxiv, (2019)
vor 4 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
myown
software
simulation
resources
myownsoftwaresimulationresources
KopierenLöschenDiese Publikation zur Ablage hinzufügen
1A Fast, Powerful Method for Detecting Identity by Descent
B. Browning, und S. Browning. American journal of human genetics, 88 (2): 173--182 (Februar 2011)
vor 13 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
software
haplotype_length
pedigrees
IBD
softwarehaplotype_lengthpedigreesIBD
KopierenLöschenDiese Publikation zur Ablage hinzufügen
2A framework for variation discovery and genotyping using next-generation DNA sequencing data
M. DePristo, E. Banks, R. Poplin, K. Garimella, J. Maguire, C. Hartl, A. Philippakis, G. del Angel, M. Rivas, M. Hanna und 8 andere Autor(en). Nat Genet, 43 (5): 491--498 (Mai 2011)
vor 10 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
GATK
genotyping_error
genotyping
software
SNP_calling
methods
short_read_data
GATKgenotyping_errorgenotypingsoftwareSNP_callingmethodsshort_read_data
KopierenLöschenDiese Publikation zur Ablage hinzufügen
1A General Approach for Haplotype Phasing across the Full Spectrum of Relatedness
J. O'Connell, D. Gurdasani, O. Delaneau, N. Pirastu, S. Ulivi, M. Cocca, M. Traglia, J. Huang, J. Huffman, I. Rudan und 17 andere Autor(en). PLoS Genet, 10 (4): e1004234 (April 2014)
vor 9 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
software
methods
phasing
softwaremethodsphasing
KopierenLöschenDiese Publikation zur Ablage hinzufügen
1A method for detecting IBD regions simultaneously in multiple individuals--with applications to disease genetics
I. Moltke, A. Albrechtsen, T. Hansen, F. Nielsen, und R. Nielsen. Genome Res, (Mai 2011)
vor 13 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
software
haplotype_length
pedigrees
IBD
softwarehaplotype_lengthpedigreesIBD
KopierenLöschenDiese Publikation zur Ablage hinzufügen
2A novel dispersal algorithm in individual-based, spatially-explicit Population Viability Analysis: A new role for genetic measures in model testing?
M. Lethbridge, und J. Strauss. Environmental Modelling & Software, (2015)
vor 9 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
conservation_genetics
software
methods
wallabys
pedigrees
PVA
population_viability_analysis
conservation_geneticssoftwaremethodswallabyspedigreesPVApopulation_viability_analysis
KopierenLöschenDiese Publikation zur Ablage hinzufügen
1A working guide to spatial mechanistic modelling in Julia
R. Schouten, V. Baudrot, P. Umina, und J. Maino. Methods in Ecology and Evolution, 13 (5): 945-954 (2022)
vor 12 Monaten von @peter.ralph
alle anzeigen
spatial_simulations
software
simulation
discrete_populations
spatial_simulationssoftwaresimulationdiscrete_populations
KopierenLöschenDiese Publikation zur Ablage hinzufügen
1Accelerating Wright--Fisher Forward Simulations on the Graphics Processing Unit
D. Lawrie. G3: Genes|Genomes|Genetics, 7 (9): 3229--3236 (August 2017)
vor 7 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
parallel_computing
software
methods
simulation
parallel_computingsoftwaremethodssimulation
KopierenLöschenDiese Publikation zur Ablage hinzufügen
1Alleles In Space (AIS): Computer Software for the Joint Analysis of Interindividual Spatial and Genetic Information
M. Miller. J Hered, 96 (6): 722-724 (2005)
vor 16 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
software
genetic_analysis
spatial_statistics
softwaregenetic_analysisspatial_statistics
KopierenLöschenDiese Publikation zur Ablage hinzufügen
1Assemblathon 2: evaluating de novo methods of genome assembly in three vertebrate species
K. Bradnam, J. Fass, A. Alexandrov, P. Baranay, M. Bechner, I. Birol, S. Boisvert, J. Chapman, G. Chapuis, R. Chikhi und 81 andere Autor(en). Gigascience, 2 (1): 10 (Juli 2013)
vor 7 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
software
genome_assembly
softwaregenome_assembly
KopierenLöschenDiese Publikation zur Ablage hinzufügen
1Assembly by Reduced Complexity (ARC): a hybrid approach for targeted assembly of homologous sequences.
S. Hunter, R. Lyon, B. Sarver, K. Hardwick, L. Forney, und M. Settles. bioRxiv, (2015)
vor 9 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
seeded_assembly
software
methods
assembly
seeded_assemblysoftwaremethodsassembly
KopierenLöschenDiese Publikation zur Ablage hinzufügen
1Backward simulation of ancestors of sampled individuals
D. Gasbarra, M. Sillanpää, und E. Arjas. Theoretical Population Biology, 67 (2): 75-83 (2005)
vor 3 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
software
methods
simulation
coalescent_theory
softwaremethodssimulationcoalescent_theory
KopierenLöschenDiese Publikation zur Ablage hinzufügen
6Bayesian phylogenetics with BEAUti and the BEAST 1.7
A. Drummond, M. Suchard, D. Xie, und A. Rambaut. Mol Biol Evol, 29 (8): 1969-1973 (August 2012)
vor 6 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
software
phylogenetics
softwarephylogenetics
KopierenLöschenDiese Publikation zur Ablage hinzufügen
7Best Practices for Scientific Computing
D. Aruliah, C. Brown, N. Hong, M. Davis, R. Guy, S. Haddock, K. Huff, I. Mitchell, M. Plumbley, B. Waugh und 3 andere Autor(en). (2012)cite arxiv:1210.0530Comment: 6 pages.
vor 12 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
software
culture
computation
softwareculturecomputation
KopierenLöschenDiese Publikation zur Ablage hinzufügen
1Challenges in funding and developing genomic software: roots and remedies
A. Siepel. Genome Biology, 20 (1): 147 (29.07.2019)
vor 3 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
funding
software
fundingsoftware
KopierenLöschenDiese Publikation zur Ablage hinzufügen
2Discoal: flexible coalescent simulations with selection
A. Kern, und D. Schrider. Bioinformatics, 32 (24): 3839--3841 (August 2016)
vor 7 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
selection
software
simulation
coalescent_theory
selectionsoftwaresimulationcoalescent_theory
KopierenLöschenDiese Publikation zur Ablage hinzufügen
2Efficient Coalescent Simulation and Genealogical Analysis for Large Sample Sizes
J. Kelleher, A. Etheridge, und G. McVean. PLoS Comput Biol, (Mai 2016)
vor 8 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
pedigree
software
methods
simulation
coalescent_theory
pedigreesoftwaremethodssimulationcoalescent_theory
KopierenLöschenDiese Publikation zur Ablage hinzufügen
3Efficient pedigree recording for fast population genetics simulation
J. Kelleher, K. Thornton, J. Ashander, und P. Ralph. PLOS Computational Biology, 14 (11): 1-21 (November 2018)
vor 6 Jahren von @peter.ralph
alle anzeigen
myown
software
ARG
methods
tree_sequence
simulation
myownsoftwareARGmethodstree_sequencesimulation
KopierenLöschenDiese Publikation zur Ablage hinzufügen

⟨⟨
⟨
1
2
3
⟩
⟩⟩

BibSonomy

Lesezeichen (verstecken)16
Anzeige
alles
nur Lesezeichen
Lesezeichen pro Seite
5
10
20
50
100
sortieren nach
hinzugefügt am
Titel
RSS
BibTeX
XML

1Python GDAL/OGR Cookbook

4Repast Suite

1RPubs - Visual Raster Cheatsheet

1SDMTools

1Spatial data in R: Using R as a GIS

1vimdiff

Publikationen (verstecken)58
Anzeige
alles
nur Publikationen
Publikationen pro Seite
5
10
20
50
100
sortieren nach
hinzugefügt am
Titel
Autor
Erscheinungsdatum
Eintragstyp
Hilfe für erweiterte Sortierung...
RSS
BibTeX
RDF
mehr...

2A C++ template library for efficient forward-time population genetic simulation of large populations

2A C++ template library for efficient forward-time population genetic simulation of large populations

1A community-maintained standard library of population genetic models

1A Fast, Powerful Method for Detecting Identity by Descent

2A framework for variation discovery and genotyping using next-generation DNA sequencing data

1A General Approach for Haplotype Phasing across the Full Spectrum of Relatedness

1A method for detecting IBD regions simultaneously in multiple individuals--with applications to disease genetics

2A novel dispersal algorithm in individual-based, spatially-explicit Population Viability Analysis: A new role for genetic measures in model testing?

1A working guide to spatial mechanistic modelling in Julia

1Accelerating Wright--Fisher Forward Simulations on the Graphics Processing Unit

1Alleles In Space (AIS): Computer Software for the Joint Analysis of Interindividual Spatial and Genetic Information

1Assemblathon 2: evaluating de novo methods of genome assembly in three vertebrate species

1Assembly by Reduced Complexity (ARC): a hybrid approach for targeted assembly of homologous sequences.

1Backward simulation of ancestors of sampled individuals

6Bayesian phylogenetics with BEAUti and the BEAST 1.7

7Best Practices for Scientific Computing

1Challenges in funding and developing genomic software: roots and remedies

2Discoal: flexible coalescent simulations with selection

2Efficient Coalescent Simulation and Genealogical Analysis for Large Sample Sizes

3Efficient pedigree recording for fast population genetics simulation

Stöbern

Verwandte Tags

Konzepte

Tags

Lesezeichen (verstecken)16 Anzeigeallesnur LesezeichenLesezeichen pro Seite5102050100 sortieren nachhinzugefügt amTitel RSSBibTeXXML

Publikationen (verstecken)58 Anzeigeallesnur PublikationenPublikationen pro Seite5102050100 sortieren nachhinzugefügt amTitelAutorErscheinungsdatumEintragstypHilfe für erweiterte Sortierung... RSSBibTeXRDFmehr...

Stöbern

Verwandte Tags

Tags

Lesezeichen (verstecken)16
Anzeige
alles
nur Lesezeichen
Lesezeichen pro Seite
5
10
20
50
100
sortieren nach
hinzugefügt am
Titel
RSS
BibTeX
XML

Publikationen (verstecken)58
Anzeige
alles
nur Publikationen
Publikationen pro Seite
5
10
20
50
100
sortieren nach
hinzugefügt am
Titel
Autor
Erscheinungsdatum
Eintragstyp
Hilfe für erweiterte Sortierung...
RSS
BibTeX
RDF
mehr...