Seit 1831 dient das Staatsarchiv als Endarchiv der Verwaltung, den Behörden, den Gerichten und Betrieben des Kantons Schaffhausen. Die Hauptbestände bilden die Hinterlassenschaften der durch die Reformation aufgehobenen Klöster Allerheiligen und Sankt Agnesen in Schaffhausen und Sankt Georgen in Stein am Rhein. Dazu kommen die Bestände der staatlichen Ämter, die bei der Aufhebung dieser Klöster zur Verwaltung des ehemaligen Klosterbesitzes geschaffen wurden.
Plattform an der Uni Fribourg für digitalisierte mittelalterliche Handschriften aus Schweizerischen Institutionen (Bibliotheken und Archive). Darunter sind auch Schaffhauser Handschriften aus der Stadtbibliothek und dem Staatsarchiv.
Schaffhauser Handschriften auf der Plattform e-codices. Darunter auch die weltberühmte Vita Columbae des Adamnan in der Abschrift des Dorbbene aus Iona (um 700).
Handschriften aus dem Staatsarchiv Schaffhausen auf der Plattform e-codices. Insb. der Richtebrief der Stadt Schaffhausen (um 1300) und das Stifterbuch von Allerheiligen (1467).
Privat betriebene Website von Bruno Sternegg (Opfertshofen). Sein kostenloses Online-Fotoarchiv zeigt über 1000 historische Fotos, oft Ansichtskarten, von Gebäuden, Plätzen und Landschaften der Region Schaffhausen. Ein Teil kommt aus dem Schaffhauser Fotoatelier Koch, anderes aus privaten Sammlungen und Räumungen.